Im nächsten Schritt wird das Molekül im DAE-Format in das OBJ-Format umgewandelt. Wer zufällig im letzten Schritt schon gesehen hat, dass Chimera auch OBJ-Dateien abspeichern kann, wird leider am Ende enttäuscht. Die Datei lässt sich leider nicht fehlerfrei weiterverarbeiten.
Zum Konvertieren kann das kostenlose MeshLab verwendet werden. Die DAE-Datei wird über „Import Mesh“ eingelesen und unter „Export Mesh as“ im OBJ-Format wieder abgespeichert, welches unter „Files of type“ auszuwählen ist.
Im folgenden Mitschnitt ist der Import und die Konvertierung der DAE-Datei in das OBJ-Format zu sehen: