Thema Progress:

Die erzeugten PDB-Dateien werden mit Chimera in eine DAE-Datei umgewandelt.

Wichtig ist zu wissen, dass die Kugel-Stab-Modellansicht beim Öffnen verloren geht und im Menü über „Actions“, „Atoms/Bonds“, „ball&stick“ wieder aktiviert werden muss.

Zweitens erfolgt das Abspeichern als DAE über „File“, „Export Scene…“ und dann Auswahl von „COLLADA (.dae)“ unter „File Type“.

Im folgenden Mitschnitt wird die Konvertierung des Wassermoleküls vom PDB- in das DAE-Format gezeigt:

wasser_dae

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